Gedung IKMS diresmikan tanggal 5 Desember 1999 oleh Menteri Agama Republik Indonesia yang kala itu dijabat oleh Drs. KH M. Tolha Hasan. Sedangkan dari Pejabat daerah diwakili  oleh Gubernur Bali yang kala itu dijabat oleh Drs. Dewa Made Beratha.  Dari MUI Bali diwakili oleh Ketua MUI Bali yang kala itu dijabat oleh H. S. Habib Adnan. Ketua Pembangunan Gedung IKMS adalah Drs. Surya Dharma yang saat itu adalah Komisaris Polisi. Sedangkan Ketua Umum IKMS saat itu dijabat oleh Yunasril Anga. Kesemuanya tertuang dalam prasasti peresmian gedung.

Prasasti ini ternyata tersimpan digudang Masjid. Menurut Sekretaris Umum Baharuddin Yusuf, SH, prasasti itu akan segera dipasang. Ini merupakan bukti sejarah.